Bioinformatique

La plateforme bioinformatique de l’unité est composée d’un serveur web hébergeant les outils web et les bases de données mis au point par les chercheurs de l’équipe, d’un serveur de fichiers pour le stockage des données et d’un serveur de calcul essentiellement utilisé pour des simulations de dynamique moléculaire.
Cette plateforme est maintenue par les ingénieurs d’études Hubert Santuz et Sylvain Léonard, en étroite collaboration avec les enseignants chercheurs Jean-Christophe Gelly, Patrick Fuchs et Pierre Poulain.

 

Outils web

Vous pouvez retrouvez les outils développés par les membres de l’équipe sur la page suivante : DSIMB tools

 

Serveur web

. Description
Rack Dell PowerEdge R710 2U
CPU 2x Intel Xeon Quadcore E5507
2.26 GHz
Mémoire Vive 16 GB

Serveur de fichiers

. Description
Rack Dell PowerEdge 1950 1U
Dell PowerVault MD1000 3U
CPU 2x Intel Xeon E5405
2.00GHz
Mémoire Vive 4 GB
Espace disque 15 To

Serveur de calcul – Iena

1 nœud maitre
– Dell PowerEdge R710 2U
– 2x Intel Xeon E5540 2.53GHz
13 nœuds de calcul
– Dell PowerEdge R410 1U
– 2x Intel Xeon E5540 2.53GHz
– 24 Gb de RAM
– Ubuntu 8.04.4 LTS édition serveur

Serveur de calcul – Serenity

Financé par la Région Ile de France (Projet Sesame) et l’INTS

1 noeud d’administration
– 2x Intel(R) Xeon(R) E5-2609 2.4 GHz
– 32 Gb RAM
– SuSe Linux Entreprise Server (SLES)
1 noeud de service
– 2x Intel(R) Xeon(R) E5-2660 2.2 GHz
– 64 Gb RAM
– SLES
1 rack leader
– 2x Intel(R) Xeon(R) E5-2603 1.8 GHz
– 32 Gb RAM
– 1 To d’espace disque
– SLES
1 MIS (Modular InfiniteStorage Server)
– 2x Intel(R) Xeon(R) E5-2609 2.4 GHz
– 128 Gb RAM
– 60 To d’espace disques
– SLES
48 noeud de calcul
– 2x Xeon E5-2670 2.6 GHz
– 32 Go RAM
– SLES